Plateforme BiGEst ICube - Bioinformatique et Génomique Est

Expertises techniques

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Développement et mise à disposition de bases de données

Protéines/ARN de plantes, protéines impliquées dans les maladies génétiques humaines, histoires évolutives, données transcriptomiques standardisés, lignées de souris génétiquement modifiées…

Développement et mise à disposition de logiciels bioinformatiques

Analyse de données protéomiques, analyse de séquences/structures d’ARN ou protéines, liens génotype/phénotype de maladies humaines, contrôle qualité de données NGS/ChIP-seq, évolution du génome, construction d’algorithmes évolutifs (GPGPUs), benchmarking…

Création de workflows

Plateforme logiciel GalaxEast (IGBMC) pour traitement de données (NGS, …) automatisés Exécution sur une grille de calcul ou Cloud: Nœud France Grilles (IPHC), ou Cloud académique IFB

Aide aux utilisateurs

Développement de logiciels, implémentation grilles / cloud