Faits marquants

Avril 2024

• 14/03: Formation Sensibilisation à la démarche qualité et à l'amélioration continue

Janvier 2024

• 23/01: Collaboration avec la plateforme de Biologie Structurale Intégrée de l'IGBMC sur l'analyse de données de fluorimétrie.

Décembre 2023

• 18/12: Réunion du groupe de travail pour la création de l'infrastructure de calcul strasbourgeoise dédiée à la bio-informatique (PIA3 MUDIS4LS)

Septembre 2023

• Contact avec le CNRS pour présenter notre article "The Quest for Orthologs orthology benchmark service in 2022" dans le rapport d'activité 2022 du CNRS en Alsace.

Août 2023

• 12/08 : Article "Abundance and diversification of repetitive elements in Decapoda genomes" (C. Rutz et al.) publié dans Genes

Juin 2023

• 01/06 : Participation à l'appel à projet GEANT networks/EOSC (European Open Science Cloud) pour accéder à des ressources informatiques cloud.

Mai 2023

• 20/05 : Le projet EN HOPE SMART4CBT (East North-Hematology Oncology PEdiatric consortium offering a research program of Social sciences, Microenvironment & multiomics Analyses in RadioTherapy resistance For Children Brain Tumors) déposé dans le cadre de l'appel à projet PEDIACRIEX23 pour la labellisation de centres de recherche intégrée d'excellence en cancérologie pédiatrique a été retenu pour audition devant le comité d'experts internationaux qui aura lieu le 28 Juin 2023.
• 22/05 : Publication de l'article "The AnnotSV webserver in 2023: updated visualization and ranking" dans Nucleic Acids Research.

Avril 2023

• 20/04: Publication de l'article "Real or fake? Measuring the impact of protein annotation errors on estimates of domain gain and loss events" dans Frontiers in Bioinformatics.

Mars 2023

• 27/03: Finalisation de la labellisation de la plateforme par le réseau CORTECS.

Novembre 2022

• 15/11: Mise en production au datacenter d'un nouveau serveur de calcul dédié à l'assemblage de grands génomes eucaryotes.
• 22/11: Lancement d'un projet d'extension de l'application GenIDA (plateforme participative pour la recherche sur les troubles neurodéveloppementaux) avec l'IGBMC et le CHU de Strasbourg.

Septembre 2022

• 17-18/09: Présentation d'OrthoInspector à la conférence Quest for Orthologs 7 (Sitges, Espagne).
• 27/09: Réunion de travail avec la société ClinFlows pour un projet d'analyse d'images médicales
• 29/09: Kickoff du projet ANR RaReTIA "the French Rare Eye Diseases Database (FREDD) for Retinitis Pigmentosa phenotype/genotype research"

Août 2022

• 22/08: Publication de l'article "Host-pathogen coevolution drives innate immune response to Aphanomyces astaci infection in freshwater crayfish: transcriptomic evidence" avec le LOEWE Centre for Translational Biodiversity genomics (Francfort)

Juin 2022

• 03/06: Réunion avec Google Cloud pour une collaboration sur le projet OrthoInspector

Mai 2022

• 12/05: Publication de l'article "The Quest for Orthologs orthology benchmark service in 2022" en lien avec le consortium Quest for Orthologs
• 17/05 : Déménagement de l'infrastructure informatique au datacenter de l'Université

Avril 2022

• 06/04 : Participation au groupe de travail "Biologie et Santé" de l'IFB (Institut Français de Bioinformatique)
• 15/04 : Début de la labellisation Cortecs

Mars 2022

• 23-24/3: Organisation de la formation "Science Ouverte & Plan de Gestion de Données" de l'IFB à l'IGBMC.
• 28/3: Rencontre avec Google Cloud pour une éventuelle collaboration sur le projet OrthoInspector et le traitement de données multi-omiques.

Février 2022

• 3/2 : Envoi de la révision de l'accord de consortium BiGEst aux DUs
• 4/2 : Visite de Suzanne LAURIOU, IFB-Core Communication Officer
• 23/2 : Envoi du dossier BiGEst pour la collecte des indicateurs et entretien budgetaire annuel de l'IFB

Janvier 2022

• 21/1: Rencontre avec la société ClinFlows à propos de la curation et anonymisation de données médicales.
• 31/1: Mise à jour de la plateforme de calcul massivement distribué Grilladin

Novembre 2021

• 18/11 : Visite du comité d'hygiène et sécurité le 18 novembre
• 09/11: Réunion de préparation de la formation "gestion de données FAIR pour la bioinformatique" avec l'IFB (Institut Français de Bioinformatique).

Octobre 2021

• 11/10 : Réunion avec les DAS du CNRS INS2I pour présenter le projet d’évolution de la plateforme BiGEst
• 13/10 : Participation à la réunion CIPI (Cellule d’Interaction entre les plateformes régionales et IFB-core) de l’Institut Francais de Bioinformatique
• 21/10 : Réunion avec le SPV du CNRS DR10 pour élaborer le protocole de groupement de plateformes BiGEst
• 27/10: Réunion de préparation d'une formation "FAIR data" dans le cadre de l'IFB (Institut Français de Bioinformatique)

Septembre 2021

• 16/9: réunion de travail à Strasbourg avec le LOEWE Centre for Translational Biodiversity genomics (TBG, Francfort) dans le cadre des projets GEODE et MetaInvert.
• 18/9: acceptation de l'article "Novel approach combining transcriptional and evolutionary signatures to identify new multiciliation genes" dans la revue Genes.

Août 2021

• 3/8: démarrage de l'assemblage et annotation de nouveaux génomes de décapodes sur le cluster de l'IFB core pour le projet GEODE (Genome Evolution of Decapods).
• 11/8: réunion de travail à Strasbourg avec le LOEWE Centre for Translational Biodiversity genomics (TBG, Francfort) dans le cadre du projet GEODE.
• 23/8: lancement de la création de la nouvelle version de la base de données de relations d'orthologie OrthoInspector.

Juillet 2021

• 26/7: acceptation du projet "RaReTIA : the French Rare Eye Diseases Database (FREDD) for Retinitis Pigmentosa phenotype/genotype research: a pilot Artificial Intelligence project" dans le cadre de l’appel à manifestations d’intérêt INSERM/ANR « Accélérer la recherche et l’innovation sur les Maladies Rares grâce aux bases de données ».

Janvier 2021

• 1/1: Création officielle de BiGEst-ICube