Expertises techniques

Les expertises techniques mises à disposition par la plateforme BiGEST-ICube pour ses utilisateurs sont :

• Conception de stratégies pour le calcul intensif. Orchestration des moyens de calculs dans le cadre de plateformes hétérogènes
• Modélisation par les données. Apprentissage automatique par programmation génétique
• Conception de stratégies d'optimisation par algorithmes évolutionnaires

La plateforme est adossée à l'équipe du CSTB d'ICube, elle bénéficie du savoir faire de ses membres notamment dans les domaines : modélisation des systèmes complexes, construction d’algorithmes évolutifs (GPGPUs), benchmarking, intelligence artificielle (explicabilité et transfert des connaissances), stratégies d'optimisation ...

Les expertises scientifiques mises à disposition par la plateforme BiGEST-ICube pour ses utilisateurs sont :

• analyse multi échelle de séquences: les relations sequence-structure-fonction-évolution sont analysés à travers différentes granulométries allant de la séquence globale jusqu'au résidu et ce dans différents contextes (structurale, fonctionnelle et évolutif)
• analyse de données omics: traitement, analyse et exploitation
• analyse fine de listes de gènes candidats: combinaison personnalisée de cascades d'outils/méthodes

La plateforme est adossée à l'équipe du CSTB d'ICube, elle bénéficiera du savoir faire de ses membres notamment dans les domaines :

• analyse, annotation et fouille de données biomédicales,
• génomique comparative, structurale et fonctionnelle et évolution du génome,
• maladies génétiques rares (ciliopathies, rétinopathies, myopathies, …)
• lien génotype/phénotype