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La plateforme BiGEst-ICube (Bioinformatique et Génomique Est - ICube) du laboratoire ICube (UMR 7357) représente un point d'entrée unique pour les services liés à la bioinformatique dans divers domaines d'application: évolutives, fonctionnelles, biomédicales… allant des métazoaires jusqu'aux levures et bactéries. Elle met à disposition de ses utilisateurs des expertises scientifiques et techniques, ainsi qu’un ensemble de services, logiciels, bases de données et matériels. Grâce à des équipements de pointe, elle offre un accès privilégié à des solutions de calcul et de stockage des données.
Trois axes thématiques :
- Omics Bio-analyse: - responsable: Laetitia Poidevin
- Relation Sequence-Structure-Fonction-Evolution: – responsable: Luc Moulinier
- Modélisation par les données, Calcul Intensif et Distribué et Infrastructure Informatique: – responsable: Arnaud Kress
Nous plaçons la qualité des données au cœur de notre expertise et de nos analyses. Nous assurons la gestion des données tout au long de leur cycle de vie: collecte, curation et traitement, analyse et exploitation, FAIRification et pérennisation. Cela implique une intégration forte entre les données et leurs moyens d'analyse, matériels et logiciels.
Ainsi la plateforme BiGEst-ICube vous accompagne dans la mise en œuvre de vos projets Data:
- Analyse de génomes, d'-omics (transcriptomique, protéomique, interactomique, lipidomique...), génomique comparative, statistiques
- Intégration des données (rôle de ‘data stewart’), en particulier dans la phase de pré-traitement
- Caractérisation de la qualité des données, en vue d'analyse automatisée
Des formations sont proposées pour les professionnels en poste.
La plateforme BiGEst-ICube est partenaire de la plateforme BiGEst de Strasbourg regroupant des équipes de l'IBMC, l'IBMP, l'IGBMC, l'IPHC et ICube.
Partenaires académiques français et internationaux :
- Institut Français de Bioinformatique (IFB)
- Plateforme GAIA (Graphics, Artificial Intelligence and data Analysis) d'ICube
- Consortium Elixir (European distributed infrastructure for life-science information)